Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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