Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Snx29Q9D3S3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx29Q9D3S3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms