Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Urm1Q9D2P4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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