Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trappc6bQ9D289 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trappc6bQ9D289 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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