Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms