Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms