Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Shisa9Q9CZN4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms