Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms