Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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