Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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