Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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