Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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