Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms