Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh23Q99PF4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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