Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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