Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms