Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ciao1Q99KN2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms