Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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