Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms