Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms