Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms