Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Ccdc58Q8R3Q6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Ccdc58Q8R3Q6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc58Q8R3Q6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc58Q8R3Q6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc58Q8R3Q6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms