Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cdk8Q8R3L8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cdk8Q8R3L8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk8Q8R3L8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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