Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm48Q8K2X2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms