Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms