Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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