Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc38Q8CDN8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc38Q8CDN8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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