Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms