Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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