Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep55Q8BT07 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms