Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem87bQ8BKU8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms