Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms