Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atg2bQ80XK6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg2bQ80XK6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms