Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pnma8aQ80VM8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms