Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc6aQ78XR0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc6aQ78XR0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trappc6aQ78XR0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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