Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trpv1Q704Y3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trpv1Q704Y3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpv1Q704Y3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trpv1Q704Y3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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