Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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