Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms