Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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