Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TroQ6DIC6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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