Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Sbno1Q689Z5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sbno1Q689Z5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Sbno1Q689Z5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sbno1Q689Z5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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