Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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