Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Defa17Q64016 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Defa17Q64016 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Defa17Q64016 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Defa17Q64016 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms