Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SnrpcQ62241 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SnrpcQ62241 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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