Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms