Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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