Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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