Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms