Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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