Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms